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▷ República Argentina Noticias: SECUENCIAN EL GENOMA DE UN HONGO QUE AFECTA A LA SOJA ⭐⭐⭐⭐⭐

miércoles, 30 de octubre de 2019

SECUENCIAN EL GENOMA DE UN HONGO QUE AFECTA A LA SOJA

Un equipo de investigadores del INTA, la FAUBA y otras instituciones logró
describir, por primera vez, el genoma completo de Cercospora kikuchii. Se
trata de un patógeno que causa el tizón morado de la hoja y la mancha
púrpura de la semilla. Este avance aporta conocimiento para el control de
ambas enfermedades.
miércoles 30 de octubre de 2019
El conocimiento del genoma del hongo que genera la enfermedad foliar de
mayor crecimiento en los últimos años en el país, permite imaginar –en un
futuro cercano– el descubrimiento de moléculas fungicidas novedosas y de
alto impacto para el control de estas enfermedades. El hallazgo fue
publicado recientemente en la revista Science y señala que, por primera
vez, se logró describir el genoma completo de Cercospora kikuchii.
Con 31.1 millones de pares de bases, el genoma completo contiene 14.721
genes. El acceso a esta información aporta conocimiento para el control de
las principales enfermedades que afectan a la soja. "Es la primera vez que
se describe el genoma de Cercospora kikuchii, lo que nos permite conocer
el genoma del patógeno que causa la enfermedad de la mancha púrpura de la
hoja", destacó Paula Fernández, investigadora del Instituto de
Biotecnología del INTA y CONICET.
Al describir el genoma "podemos revelar mecanismos esenciales de la vida
del hongo, con lo cual estamos en condiciones de redescubrir productos,
moléculas o agentes de control que puedan llegar a bloquear estos
mecanismos que hasta hoy no eran muy conocidos, lo que nos abre una
multiplicidad de opciones de estudio", reconoció Marcelo Carmona, profesor
de la Facultad de Agronomía, Universidad de Buenos Aires (UBA).
Este patógeno presenta síntomas en semillas, tallos, hojas y vainas y
afecta el número y peso de los granos en el cultivo de soja. El síntoma
foliar típico incluye coloración morada, bronceado a púrpura, con aspecto
rugoso. Mientras que en la semilla se manifiesta un manchado morado que va
desde pequeñas manchas hasta cubrirla completamente.
Mientras tanto, su manejo consiste en la utilización de semillas sanas o
tratadas eficientemente, rotación de cultivos, uso de cultivares de mejor
comportamiento y control químico con fungicidas. En la actualidad, la
eficiencia de los fungicidas para combatirlo se vio reducida como
consecuencia del surgimiento de diversas mutaciones que confieren
resistencia en varias cepas de Cercospora spp.
A partir de ahora, se tratará de conocer "los genes candidatos que afecten
la infección de este patógeno en la soja, los mecanismos de posible
tolerancia o resistencia a nuevos fungicidas, así como también los
procesos que genera la planta para poder resistir a la infección del
patógeno", explicó Fernández.
Sumar el genoma de este hongo a la secuencia completa del genoma de la
soja –descifrado hace casi 10 años–, "posibilitará identificar desde
marcadores moleculares hasta genes candidatos de la infección", reconoció
la investigadora.
De acuerdo con lo publicado, las futuras investigaciones estarán dirigidas
a interpretar todos los atributos con los que cuenta la planta para
defenderse, así como los mecanismos del patógeno para infectar y colonizar.
Las próximas investigaciones estarán dirigidas a interpretar todos los
atributos con los que cuenta la planta para defenderse, así como los
mecanismos del patógeno para infectar y colonizar
Para lograr el objetivo, los investigadores de la FAUBA tuvieron la tarea
de aislar el patógeno para extraerle el ADN y poder secuenciarlo, mientras
que en el Instituto de Biotecnología del INTA se realizó el ensamblado
mediante herramientas de bioinformática, tarea comandada por Sergio
Gonzalez. La investigación contó con aportes del INTA, UBACyT y BASF.
El trabajo fue publicado en la sección Data in Brief de la revista Science
Direct, surgido como parte de una investigación de tesis doctoral de
Francisco Sautua. Además de Fernández y Carmona, también participaron
Sergio Gonzalez –INTA–, Máximo Rivarola y Marcelo Berretta –INTA-CONICET–,
Vinson Doyle –Universidad Estatal de Louisiana, Estados Unidos–, Manuela
Gordó –Laboratorio Agrícola Río Paraná– y Mercedes Scandiani –Universidad
Nacional de Rosario–, se señala que por primera vez se logró describir el
genoma completo de Cercospora kikuchii.


真菌的基因组序列,影响大豆
一队来自INTA,FAUBA研究人员和其他机构能够来形容,第一次,思茅褐斑病的完整基
因组。这是造成叶枯病种子的紫色和紫染色的病原体。这种进步带来的意识来控制这两
种疾病。
2019周三10月30日,
在全国产生在近几年增长最快的叶部病害的真菌基因组的知识,可以想像-in近未来 -
新分子和高冲击杀菌剂来控制这些疾病的发现。该研究成果最近发表在科学,对于第一
次,我们能够描述思茅褐斑病的完整基因组注释日记。
31.1万个碱基对,其中包含完整的基因组14721个基因。获得此信息为影响大豆重大疾
病的防治知识。 "这是褐斑病的基因组思茅描述的第一次,这使我们能够知道导致这种
疾病的紫色斑病菌的基因组中,"保拉·费尔南德斯,在INTA和CONICET的生物技术研究
所的研究员。
在描述基因组"我们可能会透露真菌的生活必不可少的机制,我们能够重新找回的产
品,分子或控制剂,可以阻断最终这些机制,直到今天都没有众所周知的,它会打开一
个多个研究方案,"承认马塞洛卡莫纳,教授农学的布宜诺斯艾利斯大学(UBA)学部。
在种子这种病菌的症状,茎,叶和豆荚和影响大豆作物颗粒的数量和重量。典型的症状
叶面包括紫色显色,棕褐色为紫色,粗糙的外观。尽管紫色斑点从小型斑点种子以覆盖
完全表现出来。
同时,管理是利用健康的种子或有效地处理,轮作,采用品种更好的性能和杀菌剂的化
学控制的。目前,杀菌剂作战的效率是由于在尾孢属的几株赋予性的各种突变的出现减
少。
从现在起,它将试图披露"影响大豆机制可能耐受或对新杀菌剂性,以及流程发电厂抗
感染这种病菌感染的候选基因病原体,"费尔南德斯说。
添加真菌大豆的完整基因组序列的基因组-descifrado 10年前差不多,"将使从感染的
分子标记鉴定候选基因"承认研究员。
根据事情的发表,未来的研究将着眼于解释,告诉工厂保卫自己的所有属性,以及病原
体的机制来感染和殖民。
未来的研究将被引导到解释所有,告诉工厂保卫自己的属性,和病原体的机制来感染和
定殖
为了实现这一目标,研究人员在FAUBA有隔离病原体提取DNA并进行测序它,而在INTA组
装的生物技术研究所利用生物信息学工具,任务由塞尔吉奥·冈萨雷斯为首执行的任
务。这项研究是输入INTA UBACyT和巴斯夫。
该研究结果发表在数据的科学杂志直接的简介部分,成为一个博士论文研究Sautua旧金
山的一部分。除了费尔南德斯和卡莫纳,也是他们参加-INTA-塞尔吉奥·冈萨雷斯,马
克西莫里瓦罗拉和马塞洛Berretta -INTA-CONICET-,路易斯安那州立,美国,曼努埃
拉·戈多-Laboratory农业里约热内卢巴拉那和奔驰Scandiani -University的文森·多伊
尔-University国家Rosario-,指出,首次成功地描述思茅褐斑病的完整基因组。

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