[Italiano-Español] MINISTERIO DE CIENCIA, TECNOLOGÍA E INNOVACIÓNVIGILANCIA DE VARIANTES DE SARS-COV-2 EN CABA, PRO...

Ministero della Scienza, Tecnologia e InnovaciónVigilancia varianti di SARS-CoV-2 in CABA, Buenos Aires, Cordoba, Entre Ríos, Neuquén e Santa sorveglianza Fe varianti di SARS-CoV-2 in CABA, Buenos Aires, Cordoba, Entre Ríos, Neuquén e rapporto di Santa FeÚltimo Paese Progetto sulla situazione epidemiologica fino al 19 maggio 2021. non è stato rilevato ancora Beta (Sud Africa) e Delta la variante (India); mentre suggerire considerando lineage C. 37 (variante andino) come variante regionale di interesse, a causa del costante aumento loro frequenza di rilevamento in AMBA. Lunedi 7 Giugno 2021 Paese consorzio del progetto, creato dal Ministero della Scienza, Tecnologia e Innovazione ha pubblicato l'ultimo rapporto (rapporto n ° 23) sul monitoraggio delle varianti della SARS-CoV-2 tra il 2 aprile e il 19 maggio di quest'anno in CABA (115), Provincia di Buenos Aires (133 del GBA, due AMBA senza origine definita e 24 della sanità regioni III e X del PBA), Cordoba (30), Entre Rios (25), Neuquen (36) e Santa Fe (24). sequenziamento parziale del gene codificante la proteina Spike di SARS-CoV-2 in 341 campioni e sequenziamento dell'intero genoma in 48 campioni ottenuti da persone che vivono in CABA, PBA, Neuquén, Entre Rios, Cordoba e Santa Fe è stata eseguita. questo è stato fatto dal Consorzio Argentino Genomics SARS-CoV-2 attraverso i nodi sequenziamento del Children Hospital del Laboratorio di Virologia del Ricardo Gutierrez (HNRG, CABA) di el-INTA UGB (Castelar, PBA) Laboratorio, del Laboratorio centrale della città di Córdoba, del Laboratorio centrale di Neuquen, del Laboratorio del IDICaL della INTA-CONICET (Rafaela, Pcia. de Santa Fe) e il Laboratorio del IPAVE-CIAP-INTA (Pcia. di Cordova). è stata identificata la variante Alpha (B. 1. 1. 7 UK) in 45 casi. Di questi, nove sono CABA, 16 per GBA (GBA quattro Nord e Ovest GBA 12), quattro all'interno della PBA e due i casi non definiti origine AMBA. Inoltre, nove casi erano della provincia di Entre Rios, un caso della provincia di Neuquen e quattro casi nella provincia di Santa Fe. Con l'eccezione del caso di Neuquen, i casi sono individui senza storia di espatrio o di contatto a stretto contatto con i viaggiatori. Gamma (P.1, Manàos) variante in un totale di 181 casi sono stati identificati. Di questi, 51 casi provengono da CABA, 52 casi di GBA (GBA nove Nord, 17 GBA 26 GBA Ovest e Sud) e 12 all'interno del PBA. Inoltre, 13 casi si sono verificati nella provincia di Entre Rios, 24 casi provincia Neuquen, 14 casi nella provincia di Santa Fe e 13 casi nella provincia di Cordoba. Questi casi corrispondono alle infezioni individui senza storia di espatrio o lo stretto contatto con i viaggiatori. Nella provincia di Cordoba sono stati rilevati due casi in individui con una storia di viaggio in Paraguay e Brasile. combinando mutazioni compatibili con lignaggio C. 37 o "variante andino" (S_L452Q, S_F490S e c2169t sinonimo cambiamento nucleotide) in un totale di 127 casi sono stati identificati. Di questi, 50 casi provengono da CABA, 56 casi di GBA (GBA cinque Norte, 19 Oeste GBA e GBA 32 Sud), quattro all'interno PBA. Inoltre, due casi si sono verificati nella provincia di Entre Rios, sei casi alla provincia di Neuquen e sette casi alla provincia di Córdoba. Questi casi corrispondono alle infezioni individui senza storia di espatrio o lo stretto contatto con i viaggiatori, con l'eccezione di due casi nella provincia di Cordoba ha avuto storia di viaggio in Messico e Repubblica Dominicana. è stata rilevata la combinazione di mutazioni caratteristiche della variante Beta (B. 1. 351, Sud Africa) e Delta (B. 1. 617. 2 India). È molto importante notare che v'è stato un aumento della frequenza di rilevamento di Gamma (P.1, Manaos) varianti e lineage C. 37 (andino) e stabilizzato in frequenza Alpha variante (B. 1. 1. 7 UK ) nel AMBA nelle ultime settimane epidemiologiche nei casi senza epidemiologicamente legata al turismo estero. Così in SE16-19 Gamma (P.1, Manàos) variante frequenze raggiunto superiore al 35% nel CABA e il 27% nel GBA e lignaggio C. 37 (andino) frequenze presentati dal 42% in CABA e 32% nel GBA . Per quanto riguarda la variante Alpha (B. 1. 1. 7, UK), frequenza ridotta inferiore al 10% nel CABA e il 15% nel GBA. Anche in questo periodo, meno del 6% (CABA) e 5% (GBA) dei casi analizzati appartenevano alle altre varianti o mutazioni introdotte di interesse. Complessivamente, oltre il 95% del SARS-CoV-2 circolata in AMBA ha mutazioni nella regione codificante la proteina Spike che i virus a differenza circolante nella prima onda. Finora, per un totale di 2238 campioni analizzati mediante monitoraggio attivo attraverso il sequenziamento del punto o intero genoma, sono stati rilevati maggior parte delle varianti lineage C. 37 (variante andino) in 412 casi e variante Gamma (P. 1 Manaus) in 398 casi, soprattutto nel ultimi SE analizzati. Il progetto PAIS ritiene lineage C. 37 (variante andino) debba essere considerato l'interesse regionale variante più, dato l'aumento sostenuto loro frequenza di rilevamento nella regione della AMBA nelle ultime settimane epidemiologici è stata osservata anche nei paesi nella regione come Perù e Cile. Nuovi modi di denominazione varianti di interesse e preocupaciónEl 31 Maggio 2021, l'Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS, Organizzazione Mondiale della Sanità) ha annunciato nuove forme di chiamata varianti di interesse (VOI) e varianti di preoccupazione (COV) per facilitare la comunicazione pubblica sulle varianti di SARS-CoV-2. I motivi includono l'esistenza di diverse nomenclature genomiche difficoltà a comunicare a causa della loro complessità e delle potenziali tag stigmatizzazione assegnati ai paesi o aree di rilevamento. E 'per questo che è stato assegnato a VOI e VOC nuove modifiche basate sul greco al mondo denominate. CABA: numero di casi segnalati per settimana epidemiologica 2020-2021 dall'inizio di varianti molecolari di monitoraggio SARS-CoV-2. GBA: numero di casi segnalati per settimana epidemiologica 2020-2021 dall'inizio di varianti molecolari di monitoraggio SARS-CoV-2. partecipato a questo sequenziamento HNRG reporteNodo, Nodo sequenziamento e l'analisi UGB-INTA Castelar (Hurlingham, PBA), Nodo sequenziamento di Córdoba, Nodo sequenziamento del IDICaL (Istituto di ricerca Catena Way) del INTA-CONICET Rafaela (Provincia di Santa Fe), Neuquen sequenziamento Nodo: Laboratorio centrale di Neuquén (Ministero della Salute) (provincia di Neuquén), Nodo sequenziamento Córdoba Laboratorio centrale (Ministero della Salute in provincia di Cordoba), Istituto di Virologia "Dr. J. M. Vanella "Facoltà di Scienze Mediche, Università Nazionale di Córdoba (Córdoba), Nodo evoluzione. Insieme di nodi e l'elaborazione di campioni clinici: Virologia Laboratorio, Ospedale dei Bambini Dr. Ricardo Gutierrez (CABA), UFU Ospedale Rivadavia (CABA) Molecular Biology Laboratory, Ospedale Cosme Argerich (CABA), El Cruce Ospedale Laboratorio Dr. Nestor C. Kirchner e Medicina Traslazionale Centro CEMET (Florencio Varela, Buenos Aires), Molecular Virology Laboratory - Ospedale Blas L. Dubarry (Mercedes, PBA) Dipartimento di Scienze di base - Università nazionale di Luján (Provincia di Buenos Aires), COVID- National University Diagnostic Laboratory-UNIT Hurlingham (Hurlingham , BA), centro di ricerca di base e applicata, UNNOBA (Junín, provincia di Buenos Aires), Virologia Laboratorio dell'Ospedale JJ Urquiza (Concezione dell'Uruguay, Entre Rios), Laboratorio centrale (Santa Fe, provincia di Santa Fe), Laboratorio centrale di Neuquen, Ministero della Salute (Neuquen, provincia di Neuquen), Laboratorio centrale, Ministero della Salute Cordoba Provincia, Istituto di Virologia "Dr. J. M. Vanella "Facoltà di Scienze Mediche - Università Nazionale di Cordoba, COE COVID -Epidemiology, Buenos Aires, Biologia Molecolare Laboratorio Ospedale Pedro de Elizalde (CABA). Progetto PAISCreado dal Ministero della Scienza, Tecnologia e Innovazione dell'Argentina, il Consorzio Inter per il sequenziamento del genoma e genomici studi di SARS-CoV-2 (Project PAIS) è costituito da gruppi di ricerca di diverse istituzioni con l'obiettivo di sequenziamento del genoma ed eseguire altri studi di genomica di SARS-CoV-2. Coordinato da Dra. Mariana Viegas del Children Hospital del Laboratorio di Virologia del Ricardo Gutierrez, i lavori del team articolate e collaborativo per studi di genomica di SARS-CoV-2 nel nostro paese e contribuiscono sia alla conoscenza locale e al database globale di GISAID circolazione virale (Global iniziativa sulla condivisione di tutte Influenza Data). I suoi obiettivi circolano genomi sequenziamento di SARS-CoV-2 in diverse regioni del nostro paese, analisi su larga scala di sequenze, genoma assemblaggio, analisi filogenetica e filogeografici, epidemiologia e l'evoluzione molecolare. DescargasReporte Progetto nazione (n ° 23) _CABA, Provincia di Buenos Aires, Cordoba, Entre Ríos, Neuquén e Santa Fe (1. 12 MB) Scarica il documento

Ministerio de Ciencia, Tecnología e InnovaciónVigilancia de variantes de SARS-CoV-2 en CABA, Provincia de Buenos Aires, Córdoba, Entre Ríos, Neuquén y Santa Fe Vigilancia de variantes de SARS-CoV-2 en CABA, Provincia de Buenos Aires, Córdoba, Entre Ríos, Neuquén y Santa FeÚltimo informe de Proyecto PAIS sobre la situación epidemiológica hasta el 19 de mayo de 2021. Aún no se detectó la variante Beta (Sudáfrica) ni Delta (India); mientras que sugieren considerar al linaje C. 37 (variante Andina) como variante de interés regional, debido al incremento sostenido de su frecuencia de detección en el AMBA. lunes 07 de junio de 2021 El Consorcio Proyecto PAIS -creado desde el Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación- publicó el último informe (reporte N° 23) sobre vigilancia de variantes del SARS-CoV-2 entre el 2 de abril y el 19 de mayo de este año en CABA (115), Provincia de Buenos Aires (133 del GBA, dos de AMBA sin origen definido y 24 de las Regiones Sanitarias III y X de la PBA), Córdoba (30), Entre Ríos (25), Neuquén (36), y Santa Fe (24). Se realizó la secuenciación parcial del gen que codifica para la proteína Spike de SARS-CoV-2 en 341 muestras y la secuenciación del genoma completo en 48 muestras obtenidas de individuos residentes en CABA, PBA, Neuquén, Entre Ríos, Córdoba y Santa Fe. Esto fue realizado por el Consorcio Argentino de Genómica de SARS-CoV-2, a través de los nodos de secuenciación del Laboratorio de Virología del Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez (HNRG, CABA), del Laboratorio UGB-INTA (Castelar, PBA), del Laboratorio Central de la ciudad de Córdoba, del Laboratorio Central de Neuquén, del Laboratorio del IDICaL del INTA-CONICET (Rafaela, Pcia. de Santa Fe) y del Laboratorio del IPAVE-CIAP-INTA (Pcia. de Córdoba). Se identificó la variante Alpha (B. 1. 1. 7, Reino Unido) en 45 casos. De estos, nueve corresponden a CABA, 16 a GBA (cuatro de GBA Norte y 12 de GBA Oeste), cuatro al interior de la PBA y dos casos de AMBA sin origen definido. Además, nueve casos correspondieron a la provincia de Entre Ríos, un caso de la provincia de Neuquén y cuatro casos a la provincia de Santa Fe. Con la excepción del caso de Neuquén, los casos corresponden a individuos sin antecedente de viaje al exterior o contacto estrecho con viajeros. Se identificó la variante Gamma (P. 1, Manaos) en un total de 181 casos. De estos, 51 casos provienen de CABA, 52 casos de GBA (nueve de GBA Norte, 17 de GBA Oeste y 26 de GBA Sur) y 12 del interior de la PBA. Además, 13 casos correspondieron a la provincia de Entre Ríos, 24 casos a la provincia de Neuquén, 14 casos a la provincia de Santa Fe y 13 casos a la provincia de Córdoba. Todos estos casos corresponderían a infecciones de individuos sin antecedente de viaje al exterior o contacto estrecho con viajeros. En la provincia de Córdoba se detectaron dos casos en individuos con antecedente de viaje a Paraguay y Brasil. Se identificó la combinación de mutaciones compatibles con el linaje C. 37 o "variante Andina" (S_L452Q, S_F490S y el cambio nucleotídico sinónimo c2169t) en un total de 127 casos. De estos, 50 casos provienen de CABA, 56 casos de GBA (cinco de GBA Norte, 19 de GBA Oeste y 32 de GBA Sur), cuatro del interior de la PBA. Además, dos casos correspondieron a la provincia de Entre Ríos, seis casos a la provincia de Neuquén y siete casos a la provincia de Córdoba. Todos estos casos corresponderían a infecciones de individuos sin antecedente de viaje al exterior o contacto estrecho con viajeros, con la excepción de dos casos de la provincia de Córdoba que presentaron antecedente de viaje a México y República Dominicana. No se detectó la combinación de mutaciones característica de la variante Beta (B. 1. 351, Sudáfrica) ni de la Delta (B. 1. 617. 2, India). Es muy importante destacar que se ha observado un aumento en la frecuencia de detección de las variantes Gamma (P. 1, Manaos) y del linaje C. 37 (Andina) y una estabilización en la frecuencia de la variante Alpha, (B. 1. 1. 7, Reino Unido) en el AMBA durante las últimas semanas epidemiológicas en casos sin nexo epidemiológico con turismo al exterior. Así, en las SE16-19 la variante Gamma (P. 1, Manaos) alcanzó frecuencias superiores al 35% en la CABA y al 27% en el GBA, y el linaje C. 37 (Andina) presentó frecuencias superiores al 42% en la CABA y 32% en el GBA. En cuanto a la variante Alpha (B. 1. 1. 7, Reino Unido), disminuyó su frecuencia a menos del 10% en la CABA y del 15% en el GBA. Asimismo, en ese período, menos del 6% (CABA) y del 5% (GBA) de los casos analizados pertenecieron a las otras variantes o presentaron mutaciones de interés. En conjunto, más del 95% del SARS-CoV-2 que circuló en el AMBA posee mutaciones en la región que codifica para la proteína Spike que lo diferencia de los virus que circularon en la primera ola. Hasta el momento, sobre un total de 2238 muestras analizadas a través de la vigilancia activa por secuenciación de Spike o de genoma completo, las variantes más detectadas fueron el linaje C. 37 (variante Andina) en 412 casos y la variante Gamma (P. 1, Manaos) en 398 casos, especialmente en las últimas SE analizadas. El proyecto PAIS considera que el linaje C. 37 (variante Andina) debería ser considerado al menos, VARIANTE DE INTERÉS REGIONAL, dado el incremento sostenido de su frecuencia de detección en la región del AMBA en las últimas semanas epidemiológicas como se ha observado también en países de la región como Perú y Chile. Nuevas formas de denominar las variantes de interés y de preocupaciónEl 31 de mayo de 2021, la Organización Mundial de la Salud (WHO, World Health Organization) anunció nuevas formas de llamar a las variantes de interés (VOI) y variantes de preocupación (VOC) para facilitar la comunicación pública sobre las variantes del SARS-CoV-2. Entre las razones se incluyen la existencia de diferentes nomenclaturas genómicas difíciles de comunicar debido a su complejización y la potencial estigmatización a las etiquetas asignadas a países o áreas de detección. Es por esto, que se le asignaron a los VOI y VOC nuevas etiquetas basadas en el alfabeto griego para denominarlas mundialmente. CABA: Número de casos reportados por semana epidemiológica 2020-2021 desde el inicio de la vigilancia molecular de variantes de SARS-CoV-2. GBA: Número de casos reportados por semana epidemiológica 2020-2021 desde el inicio de la vigilancia molecular de variantes de SARS-CoV-2. Participaron en este reporteNodo secuenciación HNRG, Nodo secuenciación y análisis UGB-INTA Castelar (Hurlingham, PBA), Nodo de secuenciación de Córdoba, Nodo de secuenciación del IDICaL (Instituto de Investigaciones en la Cadena Láctea) del INTA-CONICET de Rafaela (Provincia de Santa Fe), Nodo de secuenciación Neuquén: Laboratorio Central de Neuquén (Ministerio de Salud) (Provincia de Neuquén), Nodo de secuenciación Laboratorio Central de Córdoba (Ministerio de Salud, provincia de Córdoba), Instituto de Virología "Dr. J. M. Vanella" Facultad de Ciencias Médicas, Universidad Nacional de Córdoba (provincia de Córdoba), Nodo evolución. Nodos de toma y procesamiento de muestras clínicas: Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez (CABA), UFU Hospital Rivadavia (CABA), Laboratorio de Biología Molecular, Hospital Cosme Argerich (CABA), Laboratorio de Hospital El Cruce Dr. Néstor C. Kirchner y Centro de Medicina Traslacional CEMET (Florencio Varela, provincia de Buenos Aires), Laboratorio de Virología Molecular – Hospital Blas L. Dubarry (Mercedes, PBA) Departamento de Ciencias Básicas – Universidad Nacional de Luján (provincia de Buenos Aires), Laboratorio de Diagnóstico-UNIDAD COVID- Universidad Nacional de Hurlingham (Hurlingham, BA), Centro de Investigaciones Básicas y Aplicadas, UNNOBA (Junín, provincia de Buenos Aires), Laboratorio de Virología del Hospital JJ Urquiza (Concepción del Uruguay, Entre Ríos), Laboratorio Central (Santa Fe; provincia de Santa Fe), Laboratorio Central de Neuquén, Ministerio de Salud (Neuquén, provincia de Neuquén), Laboratorio Central, Ministerio de Salud de la provincia de Córdoba, Instituto de Virología "Dr. J. M. Vanella" Facultad de Ciencias Médicas - Universidad Nacional de Córdoba, COE COVID -Epidemiología, Ciudad de Buenos Aires, Laboratorio de Biología Molecular Hospital Pedro de Elizalde (CABA). Proyecto PAISCreado desde el Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación de la Nación, el Consorcio interinstitucional para la Secuenciación del genoma y estudios genómicos de SARS-CoV-2 (Proyecto PAIS) está conformado por grupos de investigación de diferentes instituciones con el objetivo de secuenciar el genoma y realizar demás estudios genómicos del SARS-CoV-2. Coordinado por la Dra. Mariana Viegas del Laboratorio de Virología Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez, el equipo trabaja articulada y colaborativamente para realizar estudios genómicos de SARS-CoV-2 en nuestro país y aportar tanto al conocimiento local como a la base de datos global de circulación viral GISAID (Global Initiative on Sharing All Influenza Data). Entre sus objetivos se encuentran la secuenciación de los genomas circulantes de SARS-CoV-2 en distintas regiones de nuestro país, el análisis a gran escala de secuencias, ensamblado de genomas, análisis filogenéticos y filogeográficos, epidemiología y evolución molecular. DescargasReporte Proyecto PAIS (N°23)_CABA, Provincia de Buenos Aires, Córdoba, Entre Ríos, Neuquén y Santa Fe (1. 12 MB) Descargar archivo